一、施工合同备案是由业主还是施工单位办
施工合同备案是由建设单位办理的。施工合同即建筑安装工程承包合同，是发包人和承包人为完成商定的建筑安装工程，明确相互权利、义务关系的合同。
《房屋建筑和市政基础设施工程施工招标投标管理办法》第47条规定“订立书面合同7日内，中标人应当将合同送县级以上建设行政主管部门备案;在施工过程中，各级政府建设工程质量监督管理部门还要对工程建设的质量进行全面监督。
施工许可证由建设单位办理，但是办理施工许可证之前有许多手续要办。施工承包中标通知书和承包合同备案，监理中标通知书和监理合同备案，然后是质监、安监，最后是施工许可证。建设单位办理，施工单位和监理单位配合的。
二、施工合同应包含哪些内容
可以依据国家颁布的有关合同示范文本拟定建设工程承发包合同专用条款，并特别注意以下条款：
1、工程名称、地点、范围和内容;
2、工期，包括整体工程的开、竣工工期以及中间交付工程的开、竣工工期;
3、工程质量保修期及保修条件;
4、工程造价;
5、工程验收及工程价款的支付、结算方式、支付方式;
6、设计文件及概算预算、技术资料的提供日期及提供方式;
7、材料的供应及材料进场期限;
8、工程变更;
9、违约、索赔和争议;
10、当事人约定的其他事项。
三、施工许可证由谁办理
施工许可证由建设单位办理，但是办理施工许可证之前有许多手续要办。施工承包中标通知书和承包合同备案，监理中标通知书和监理合同备案，然后是质监、安监，最后是施工许可证。建设单位办理，施工单位和监理单位配合的。
综合上面所说的，施工合同备案已不再是强制性的，而且国家已取消了此规定，只要在签订好合同之后办理好相关的证件即可施工，如果建设部门未办理施工许可证就开工，那么国家是可以认定此建筑是属于违法的，一般是受不到国家的保护。
在进行施工合同备案的时候一般就是根据实际的情况由这个建设单位来进行合同的备案，在进行合同备案的时候也需要准备好相关的材料，然后再根据流程来进行合同的备案，所以在这个时候最好就是提前了解清楚。
