辞职员工是否可以凭调休单要求支付加班工资
可以。
首先，公司安排加班时，按规定要与员工协商，如果双方对加班调休与加班费协商一致，那么员工加班后即可以自主选择加班补偿。
因为约定劳动合同时，按照双方意思自治原则，所以只要双方对约定达成一致，那么便可以按该约定进行。
其次，双方协商不一致的，原则上，在休息日安排加班的，可以优先安排员工休，如果实在不能安排调休，就要支付加班费。
因此，一般情况下，未能协商给予员工自主权的，就要按照这个方法选择调休还是支付加班费。
最后，公司安排员工加班后，又不肯按规定进行调休或支付加班费的，必要时可以按照以下步骤申请劳动仲裁：
1、先要准备好如下材料：
(1)劳动争议申诉书一式三份；
(2)到工商局查询公司的工商登记资料一份；
(3)本人的身份证复印件一份；
(4)复印证据资料一式三份，如劳动合同或协议、工资单、工牌、上班打卡记录、同事的证人证言等。
2、向有管辖权的劳动仲裁委员会申请仲裁，一般都是向所在区、县的劳动仲裁委员会申请仲裁。
另外，员工加班后一般是根据公司的安排确定调休还是支付加班费，如果未按规定进行加班补偿的，就要根据以上规定申请劳动仲裁，或是劳动仲裁处理不下的，还可以接着去法院起诉。
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